Согласно постановления Правительства Республики Казахстан от 1 декабря 2004 г. № 1247 «О реорганизации государственного учреждения: «Республиканский клинический госпиталь для ветеранов Отечественной войны» Министерства здравоохранения организовано в Астане путём отделения - государственное учреждение «Центральный клинический госпиталь для ветеранов Отечественной войны» на 104 койки. В сентябре 2009 года Постановлением Правительства РК статус госучреждения был изменён на госпредприятие.
Реорганизация позволила высоко организовать работу в госпитале на столичном уровне, применение самых эффективных медицинских препаратов и технологи лечения, что способствуют быстрому выздоровлению больных, придают им уверенность и надежду на полноценную, долголетнюю жизнь. Наши пациенты безоговорочно предпочитают лечиться именно в Центральном клиническом госпитале, при наличии у них права на первоочередное обслуживание во всех медицинских организациях республики.